هنگام شروع فرآیند انجام پایان نامه متوجه خواهید شد که موضوعات کاربردی و نظری فراوان هستند و هر موضوعی می تواند بر مبنای هدفی که دنبال می شود، بررسی گردد. اما این که آیا این موضوع خوب است، به کاربرد دستاوردهای پژوهش در جامعه یا سهمی که در حل پاره ای از مسائل موجود بازی می کند، بستگی دارد. لذا بهتر است که موضوع پایان نامه ها درباره مسائل موجودی باشد که در حوزه تخصصی وجود دارد. برای مشاوره در زمینه انتخاب موضوع و نگارش پایان نامه می توانید با موسسه ایده پردازان ره جوی شریف (دکترین) تماس حاصل کنید.
در انتخاب مسئله پژوهش، نکته هایی باید توجه کرد که مهم ترین آنها عبارتند از:
در نهایت باید توجه داشت که انتخاب استاد راهنمای مورد نظر و متقاعد کردن او برای پذیرش سرپرستی پایان نامه، وظیفه دانشجو است. در این که آیا اول استاد راهنما انتخاب شود و سپس موضوع پایان نامه یا رساله به تصویب کمیته یا گروه آموزشی برسد، یا برعکس، یا به طور همزمان، بستگی به خط مشی گروه آموزشی دارد. گاه اتفاق می افتد که موضوعی توسط دانشجو انتخاب شده ولی استاد راهنمایی برای آن پیدا نشده و به ناچار دانشجو پس از مدتی باید موضوعی دیگر را انتخاب کند و از همه مهمتر موضوع انتخابی باید با رشته تحصیلی دانشجو مرتبط باشد، استاد راهنما و کمیته تحصیلات تکمیلی موظف هستند با بررسی قبلی افق روشنی را برای انتخاب موضوع فرا راه دانشجویان قرار دهند. آگاهی اعضای گروه آموزشی از نیازها و پیشرفت های علمی در سطح کشور و جهان و سازمان های علمی، پژوهشی و کاربردی می تواند در این زمینه موثر باشد. بسیاری از سازمانهای علمی و پژوهشی علاقمند، فهرستی از زمینه های مورد علاقه خود را در اختیار دانشگاه ها و گروه های آموزشی قرار می دهند تا به هنگام انتخاب موضوع پایان نامه توسط دانشجویان استفاده شود.