اگر چه کسب و کارهای خانگی در مسیر تولید با موانع و مشکلات بسیاری روبرو هستند اما اهم موانع تولید در کسب و کارهای خانگی را می توان به شرح زیر برشمرد:
واردات بی رویه و بدون ضابطه کالاهای خارجی دارای مشابه داخلی، مقررات زاید و دست و پاگیر و غیر لازم ، عدم انجام حمایت های دولتی توسط دستگاه های اجرایی که به موجب قانون در این خصوص وظیفه دارند، عدم همکاری بانک ها در اعطاء تسهیلات قرض الحسنه، عدم وجود شبکه یکپارچه عرضه تولیدات خانگی به بازار داخل و خارج از کشور