اکثر کودهای شیمیایی (مثلاً کودهای نیتروژن معدنی) در کشاورزی ارگانیک مجاز نیستند. تنها کودهای مجاز آنهایی هستند که برای استفاده در کشاورزی ارگانیک تایید شده اند.
با این حال، حاصلخیزی مناسب خاک برای رشد گیاه حیاتی است. عمدتاً نیتروژن و همچنین فسفر و پتاسیم عناصر ضروری در مراحل رشد رویشی گیاه هستند. از آنجایی که کودهای معمولی مجاز نیستند، برخی از بهترین کودهای آلی عبارتند از:
تولید کود سبز با کاشت یک گیاه یکساله یا چند ساله (یونجه، ماشک) در مزرعه آغاز می شود. این روش حاصلخیزی خاک و ساختار خاک را بهبود می بخشد. جذب آب و رطوبت خاک را افزایش می دهد. این روش به عنوان روش کنترل علف های هرز نیز کاربرد دارد. از گیاهان تثبیت کننده نیتروژن مانند یونجه، شبدر خزنده، لوبیا، لوپین، نخود، نخود و غیره به طور گسترده استفاده می شود. از غلات مانند جو و جو نیز استفاده می شود. این گیاهان (به ویژه حبوبات) مقادیر قابل توجهی از مواد مغذی را جذب می کنند. در صورت ادغام در خاک، مواد مغذی در خاک رها می شود و برای محصولات بعدی در دسترس قرار می گیرد.) اگر تولید کننده تصمیم به استفاده از این روش داشته باشد، لازم است از مواد تکثیر (بذر) استفاده شود که در رده ارگانیسم های اصلاح شده ژنتیکی قرار نمی گیرند. .
کمپوست سازی یک فرآیند طبیعی است که در آن گروه های خاصی از میکروارگانیسم ها مانند باکتری ها مواد آلی را به هوموس تبدیل می کنند. پس از اتمام فرآوری، کمپوست تولید می شود. کمپوست از مخلوطی از مواد آلی، مواد مغذی و عناصر کمیاب تشکیل شده است. این یک روش کوددهی طبیعی با خواص عالی افزایش دهنده خاک است. با این حال، قبل از استفاده از کمپوست، باید با کشاورز دارای مجوز محلی خود مشورت کنید.
روش دیگر کوددهی آلی استفاده از کود دامی است. معمولاً از کود حیوانی مزارع ارگانیک استفاده می شود. کود باید به خوبی پوسیده باشد و می توان آن را در اطراف گیاهان استفاده کرد. با این حال، قبل از استفاده از کود باید با یک متخصص کشاورزی دارای مجوز محلی خود مشورت کنید. سایر کشاورزان به منظور بهبود حاصلخیزی خاک و کنترل علف های هرز، سطح خاک را با مواد گیاهی مرده می پوشانند. این روش به مالچ پاشی معروف است.
تولید هیدروپونیک معمولاً مجاز نیست. هیدروپونیک روشی است که بر اساس آن تولیدکنندگان از خاک برای رشد گیاهان خود استفاده نمی کنند. در عوض، آنها از یک محیط بی اثر غنی شده با محلول های غذایی استفاده می کنند و در آنجا ریشه گیاهان خود را قرار می دهند. به گفته مقامات اکثر کشورها، محصولات ارگانیک باید در خاک زنده کشت شوند. با این حال، مقامات ایالات متحده اخیراً به برخی مزارع هیدروپونیک اجازه داده اند تا محصولات خود را به عنوان ارگانیک برچسب گذاری کنند.
