سانتریفیوژ های عادی در محیط آزمایشگاه قرار گرفته و و تنها با چرخش به جداسازی ذرات می پردازند. ولی در سانتریفیوژ خلا از دما و یا ایجاد یک محیط خلا در داخل سانتریفیوژ جهت جداسازی ذرات و بالا بردن درجه خلوص استفاده می شود.
به این صورت که جهت جلوگیری از خراب شدن نمونه ها و بدون رساندن آنها به دمای جوش آب اضافی نمونه ها را در فضای خلا که توسط سانتریفیوژ ایجاد می شود ، تبخیر کرده و جداسازی ذرات جامد موجود در محلول با کیفیت بسیار بالایی صورت می گیرد. در واقع به عنوان ابزاری برای تصفیه محلول ها در آزمایشگاه استفاده می شود.
برای تهیه نمونه های ماکرومولکول نیز از سانتریفیوژ خلا استفاده می شود. ماکرومولکول ها برای انجام کار های تحقیقاتی مورد استفاده قرار می گیرند. از نمونه های ماکرومولکول ها می توان پروتئین ها ، پپتید ها ، اسید های نوکلئیک را نام برد. این موارد در انجام آزمایش های بسیار زیادی در آزمایشگاه های پژوهشی و تحقیقاتی مورد استفاده قرار می گیرند.
این نوع سانتریفیوژ بسیار کاربردی بوده و در تمامی آزمایشگاه هایی که دقت تجزیه در آنها بسیار بالا می باشد ، مورد استفاده قرار می گیرد. و به نوعی مکمل سانتریفیوژ های عادی می باشد. هنگام خرید سانتریفیوژ باید مشخص کنید در آزمایشگاهتان قصد انجام چه نوع آزمایش هایی را دارید و با توجه به نوع آزمایش خود دستگاه مورد نظر خود را انتخاب کنید.
این امکانات اضافی باعث افزایش قیمت سانتریفیوژ خواهد شد. البته در بسیاری از موارد و برای انجام آزمایش های خاص نیاز به سانتریفیوژ با دقت بالا داریم و باید از قیمت های بالای آن چشم پوشی کرد. البته می توان با خرید سانتریفیوژ های ایرانی از شرکت های معتبر هم در هزینه صرفه جویی کرده و هم دستگاه مرغوب خریداری کرد.