برای تشخیص ساختار پروتئین کاربرد دارد. ابتدا نور را پلاریزه می کنند و سپس آن را به صورت پلاریزه سیرکولار راست گرد و چپ گرد در می آوررند. مقدار شدت این نور راست گرد و چپ گرد پلاریزه یکسان است، بعد آنرا به محلول که از نظر نوری فعال است می تابانند. مقدار جذب نور راست گرد و چپ گرد پلاریزه تابیده شده در یک ماده مشخص متفاوت است، این تفاوت را بر اساس قاعده بیر و لامبرت حساب میکنند و بر روی یک نمودار رسم می کنند که محور افقی طول موج های مختلف است و محور عمودی همان اعدادی است که از تفاوت جذب نور پلاریزه به دست آمده و آنرا رسم می کنند. از آنجا که برای مثلا آلفا هلیکس یا بتا شیت در پروتئین نمودار مشخصی دارند. از مقایسه پروتئین ناشناخته با آن می توانند درصد آنها را در ساختار ثانویه بدست بیاورند و گزارش کنند.
در واقع خروجی دستگاه یک سری عدد و رقم است که بایستی با نرم افزار خاضی آنالیز شود و در صدها ارائه شوند.
کاربردهای متنوعی دارد از جمله اینکه دستگاه می تواند به صورت اتوماتیک تغییر ساختار پروتئین در اثر عواملی مثل دما یا pH را اندازه گرفته و نشان دهد.
جزئیات آن خیلی دقیق و با حوصله در یوتیوب در این لینک (https://www.youtube.com/watch?v=a81cDH26f7A) ارائه شده است.
برای درک این روش باید با مفهوم نور پلاریزه آشنا بود، در یوتیوب ویدئوهای متعددی وجود دارد که هر کدام از یک جنبه توضیح دادند ولی توضیح این لینک (https://www.youtube.com/watch?v=U8FanZu4X1I) برای من خیلی ملموس بود. از یک شبکه موازی فلزی و یک سیم برای توضیح پلاریزه شدن استفاده کرد، خیلی جالب بود.
این لینک (https://www.youtube.com/watch?v=hJNOwGj8dhQ) هم اطلاعات خوبی در مورد عملکرد دستگاه، خروجی آن و نحوه محاسبه می دهد.