گندزدایی آخرین مرحله در تصفیه آب است. در طی این مرحله، میکروب های مضر مانند باکتری ها ، ویروس ها از طریق افزودن مواد شیمیایی ضدعفونی کننده از بین می روند .
. در مرحله بعد از آن حوض آب به مرحله بعدی یعنی فیلتراسیون منتقل می شود که ذرات معلق باقی مانده و لخته های ته نشین نشده علاوه بر بسیاری از میکروارگانیسم ها و جلبک ها را حذف می کند .
