هزینه ثبت نام آزمون دکتری هر سال تغییر خواهد کرد. به علاوه هزینه ثبت نام آزمون دکتری با تاخیر نیز با هزینه ثبت نام در حالت عادی متفاوت می باشد. داوطلبان آزمون دکتری برای ثبت‌نام، ابتدا باید سریال کارت اعتباری ثبت‌نام را خریداری کرده و سپس جهت وارد کردن اطلاعات خود در سامانه اقدام کنند. لازم به ذکر است که هزینه ثبت‌نام آزمون دکتری جهت برگزاری تمامی مراحل کنکور دکتری سراسری و نیز بررسی پاسخبرگ آزمون از داوطلبان گرفته می‌شود تا بدون روند آزمون دکتری از زمان ثبت‌نام تا اعلام نتایج نهایی دکتری، بدون هیچ مشکلی اجرا شود.
هزینه ثبت‌نام آزمون دکتری از دو بخش ثبت‌نام در یک کد رشته امتحانی و خدمات پیام کوتاه تشکیل شده که هر داوطلب با توجه به نیاز خود می‌تواند نسبت به پرداخت آن اقدام نموده و از تسهیلات و خدمات مربوطه بهره‌مند شود.
هزینه ثبت‌نام آزمون دکتری 1402 برای هر کد رشته امتحانی حدود 378 هزار تومان مشخص شده است. لازم به ذکر است متقاضیانی که از ثبت‌نام جا مانده بودند باید برای خرید کارت اعتباری ثبت‌نام حدود 628 هزار تومان پرداخت کنند.
هزینه ثبت‌نام آزمون دکتری 1403 در حال حاضر هنوز اعلام نشده است؛ اما با توجه به میزان تورم در کشور، این مبلغ قطعا افزایش خواهد داشت.
