یکی از مشکلات مهم در مزارع گوجه فرنگی، سیاه شدن و پوسیدگی زیر گوجه فرنگی (گلگاه) است. زمانی که گوجه ها به حالت نیمه رسیده میرسند، در انتهای آنها نواحی قهوه ای به وجود می آید. علت اصلی پوسیدگی و سیاه شدن گلگاه گوجه فرنگی، کمبود کلسیم است. مهم ترین وظیه کلسیم استحکام دیواره سلولی و بافت های گیاهی است. کلسیم با تقویت دیوار سلولی، باعث افزایش مقاومت گیاه در برابر آفات و بیماری ها میشود. بنابرین کلسیم وظایف مهمی در گیاه بر عهده دارد، اما جزو عناصر کند حرکت محسوب میشود و تنها راه رسیدن این عنصر به میوه توسط آوندهای چوبی از سمت ریشه به سمت اندام های هوایی گیاه است. همچنین کلسیم توسط جریان آب در گیاه جابجا می شود. بنابرین اگر آبیاری محدود باشد، جذب عنصر کلسیم نیز کاهش می یابد و گیاه با کمبود کلسیم مواجه خواهد شد.
یکی دیگر از دلایل کمبود کلسیم در گیاه، رقابت عناصر غذایی در خاک است. معمولا در خاکهایی که غلظت بالایی از نیتروژن، فسفر، منیزم و پتاسیم دارند، جذب کلسیم توسط گیاه کاهش می یابد و گیاه با کمبود کلسیم مواجه میشود.
برای پیشگیری و کنترل عارضه پوسیدگی گلگاه دو راهکار وجود دارد: