ناتامایسین به عنوان یک ضد کپک مؤثر به کار می‌رود زیرا یک آنتی‌بیوتیک طبیعی است که توسط باکتری‌های Streptomyces تولید می‌شود. این ماده به طور خاص بر روی قارچ‌ها و کپک‌ها تأثیر دارد، بدون اینکه باکتری‌های مفید یا مخمرها را تحت تأثیر قرار دهد. ناتامایسین با مهار رشد سلول‌های قارچی از طریق تخریب دیواره سلولی آن‌ها عمل می‌کند.
این ماده به دلیل طبیعی بودن، سمیت کم برای انسان و حیوانات، و تأثیر طولانی‌مدت، در صنایع غذایی به عنوان نگهدارنده برای جلوگیری از رشد کپک در محصولات مختلفی مانند لبنیات، نان و محصولات گوشتی استفاده می‌شود.
