سید مسعود مقام دولتی یا رسمی ندارد. علاوه بر این، پدرش (سید علی حسینی خامنهای) پسرانش را از پذیرش مناصب دولتی یا مشابه منع کردهاست. سید مسعود بیشترین تلاش را – بین فرزندان سید علی خامنهای – در جمعآوری آثار پدرش در دفتر حفظ و نشر آثار دارد.
