با اینکه تفاوت‌ها در طراحی مگنترون کاتدهای غیرتعادلی و تعادلی ناچیز است اما تفاوت کارآیی آنها قابل توجه است. در مگنترون تعادلی قطب‌های آهنرباهای مگنترون دارای قدرت یکسانی هستند، بنابراین پلاسما در مگنترون تعادلی کاملا مقید به محدوده هدف است، محدوده‌ای که پلاسمای چگال تا حدود ۶۰ mm بالای هدف گسترده می‌شود.
